Nama Kayu Kubu berasal dari gabungan kata 'kayu' dan 'kubu' yang mengacu pada keberadaan kayu sebagai sumber daya alam, serta kubu atau benteng sebagai sarana pertahanan pada masa lalu. Kawasan pertahanan sejak masa kolonial Belanda dilakukan di dekat wilayah sekitar Jam Gadang, terutama setelah pembangunan Fort de Kock pada tahun 1825 yang menjadikan wilayah Bukittinggi sebagai daerah strategis pertahanan.